近红外常用的数据分析软件网址

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对于想要了解近红外硬件的可参考学术导航网址：https://7988888.xyz/daohang/#row-13

常见分析软件：

• Homer3

https://github.com/BUNPC/Homer3

Homer3是Matlab应用程序，用于分析fNIRS数据以获得大脑激活的估计图

资源介绍：https://www.bilibili.com/video/BV1Fg4y1q71J?from=search&seid=13706606535957346752

• Homer2

http://homer-fnirs.org/

资源介绍：https://www.bilibili.com/video/BV1xJ411p7Et?from=search&seid=8514344839950252914

• NIRS-SPM

https://www.nitrc.org/projects/nirs_spm

资源介绍：B站搜索关键词“NIRS-SPM”

• FC-NIRS

https://www.nitrc.org/projects/fcnirs

FC-NIRS是用于近红外光谱数据的功能连通性分析工具，该软件包的功能包括预处理，质量控制，FC计算和网络分析。

资源介绍：B站搜索关键词“FC-NIRS”

• NIRS-KIT

https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT

NIRS-KIT是基于Matlab的工具箱，用于任务和静止状态fNIRS数据分析。适合分析Hitachi和shimazhu的采集数据

资源介绍：https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT/blob/master/NIRS_KIT_UserManual_HouXin.pptx

• NIRS-toolbox

https://github.com/huppertt/nirs-toolbox

NIRS-toolbox是匹兹堡大学的Huppert实验室建立的近红外数据分析工具箱。

资源介绍：https://bitbucket.org/huppertt/nirs-toolbox/wiki/Home

• MNE-Python

https://mne.tools/stable/auto_tutorials/io/plot_30_reading_fnirs_data.html#sphx-glr-auto-tutorials-io-plot-30-reading-fnirs-data-py

用于在Python下的分析MEG/EEG/fNIRS工具箱，可以使用读取NIRx记录mne.io.read_raw_nirx()

• BrainStorm3: https://neuroimage.usc.edu/brainstorm

• Nirstorm

https://github.com/Nirstorm/nirstorm

Nirstorm是基于brainstorm3插件的分析fnirs数据的工具。

一些近红外公司的软件（也是免费下载）

• Open PoTATo

https://github.com/hkwgc/open-potato

Open PoTATo是基于Hitachi，Ltd.开发的光学分析工具软件平台（通常称为POTATo）开发的。进行信号预处理，统计分析和可视化。

• NIRSlab

https://www.nitrc.org/projects/fnirs_downstate

NIRSlab是NIRX自带的光学分析平台。

预处理资源

此资源公开在GitHub上，遵守CC-BY-NC协议。

代码：https://github.com/smburns47/preprocessingfNIRS

视频：可查看BrainTechnology之前推送视频

近红外定位的参考fOLD

https://github.com/nirx/fOLD-public

该工具箱允许基于五种分割方法的解剖学界标的光极探头布置，也可以加载fMRI数据（NIfTI或ANALYZE）作为fNIRS光极位置。

谢谢大家观看，如有帮助，来个喜欢或者关注吧！

本文作者：Chen Rui