Chen Rui
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  1. fNIRS近红外脑成像

近红外常用的数据分析软件网址

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最后更新于3年前

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本文首发在个人博客上(),此文章中所有链接均通过博客进行访问。

对于想要了解近红外硬件的可参考学术导航网址:

常见分析软件:

• Homer3

Homer3是Matlab应用程序,用于分析fNIRS数据以获得大脑激活的估计图

资源介绍:

• Homer2

资源介绍:

• NIRS-SPM

资源介绍:B站搜索关键词“NIRS-SPM”

• FC-NIRS

FC-NIRS是用于近红外光谱数据的功能连通性分析工具,该软件包的功能包括预处理,质量控制,FC计算和网络分析。

资源介绍:B站搜索关键词“FC-NIRS”

• NIRS-KIT

NIRS-KIT是基于Matlab的工具箱,用于任务和静止状态fNIRS数据分析。适合分析Hitachi和shimazhu的采集数据

• NIRS-toolbox

NIRS-toolbox是匹兹堡大学的Huppert实验室建立的近红外数据分析工具箱。

• MNE-Python

用于在Python下的分析MEG/EEG/fNIRS工具箱,可以使用读取NIRx记录mne.io.read_raw_nirx()

• Nirstorm

Nirstorm是基于brainstorm3插件的分析fnirs数据的工具。

一些近红外公司的软件(也是免费下载)

• Open PoTATo

Open PoTATo是基于Hitachi,Ltd.开发的光学分析工具软件平台(通常称为POTATo)开发的。进行信号预处理,统计分析和可视化。

• NIRSlab

NIRSlab是NIRX自带的光学分析平台。

预处理资源

此资源公开在GitHub上,遵守CC-BY-NC协议。

视频:可查看BrainTechnology之前推送视频

近红外定位的参考fOLD

该工具箱允许基于五种分割方法的解剖学界标的光极探头布置,也可以加载fMRI数据(NIfTI或ANALYZE)作为fNIRS光极位置。

谢谢大家观看,如有帮助,来个喜欢或者关注吧!

本文作者:Chen Rui

资源介绍:

资源介绍:

• BrainStorm3:

代码:

7988888.xyz
https://7988888.xyz/daohang/#row-13
https://github.com/BUNPC/Homer3
https://www.bilibili.com/video/BV1Fg4y1q71J?from=search&seid=13706606535957346752
http://homer-fnirs.org/
https://www.bilibili.com/video/BV1xJ411p7Et?from=search&seid=8514344839950252914
https://www.nitrc.org/projects/nirs_spm
https://www.nitrc.org/projects/fcnirs
https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT
https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT/blob/master/NIRS_KIT_UserManual_HouXin.pptx
https://github.com/huppertt/nirs-toolbox
https://bitbucket.org/huppertt/nirs-toolbox/wiki/Home
https://mne.tools/stable/auto_tutorials/io/plot_30_reading_fnirs_data.html#sphx-glr-auto-tutorials-io-plot-30-reading-fnirs-data-py
https://neuroimage.usc.edu/brainstorm
https://github.com/Nirstorm/nirstorm
https://github.com/hkwgc/open-potato
https://www.nitrc.org/projects/fnirs_downstate
https://github.com/smburns47/preprocessingfNIRS
https://github.com/nirx/fOLD-public